Historia powstania klubu Nogometni Klub Istra 1961 Pula jest zawiła, korzeni należy szukać w latach 1947-1948, kiedy w Puli założono klub NK. NK Pula połączyła się z NK Uljanik w 1961 roku, w wyniku fuzji powstała NK Istra. W 1964 roku fuzja się zakończyła, kluby się rozłączyły. Fani klubu z Puli mają przyjacielskie relacje z Sandecją Nowy Sącz. NK Pula jest w złych relacjach zarówno z kibicami Dinama Zagrzeb jak też HNK Rijeka.
W 1992 roku, Istra zadebiutowała w I lidze Chorwacji. Wielkimi sukcesami na miarę klubu z półwyspu Istria są:
- 1. 6.lokaty w Pierwszej Lidze Chorwacji wywalczone w sezonach 2012/13, 2013/14 i 2016/17
- 2. finał Pucharu Chorwacji 2002/03.
Aldo Drosina to legendarny piłkarz NK Istra, którego nazwiskiem nazwano miejscowy stadion. Na przestrzeni ostatnich sezonów najlepszym piłkarzem Istra Pula jest Slavko Blagojević, specjalista od stałych fragmentów gry, były młodzieżowy reprezentant Chorwacji.
Herb klubowy barwami zielono-żółtymi nawiązuje do herbu chorwackiego miasta Pula, z którego pochodzi.
